НИИ, нескл., м. (сокр.: научно-исследовательский институт)
НИИ... – часть сложносокращенных слов, пишется слитно, напр.: НИИнефтегаз, НИИхимпром, НИИтеплоприбор, ГипроНИИполиграф, ГипродорНИИ